近日,课题组关于同型产乙酸菌基因组进化的最新研究成果“Reduction, evolutionary pattern and positive selection of genes encoding formate dehydrogenase in Wood-Ljungdahl pathway of gastrointestinal acetogens suggests their adaptation to formate-rich habitats”被Environmental Microbiology Reports杂志接受。
本论文在前期发现牛粪来源的同型产乙酸菌Clostridium bovifaecis缺失催化Wood-Ljugdahl途径甲基支路的第一步—甲酸脱氢酶,推测与其适应富含甲酸的胃肠道环境进化有关的研究基础上,对已知的43种同型产乙酸菌113个基因组进行Wood-Ljugdahl途径相关基因拷贝数统计、系统发育学分析和环境选择压模型计算,发现了胃肠道同型产乙酸菌的甲酸脱氢酶基因拷贝数显著低于非胃肠道同型产乙酸菌,并且仅在甲酸脱氢酶基因上检测到7个正选择位点,甲酸脱氢酶基因的系统发育进化图谱与Wood-Ljugdahl途径其它基因存在明显差异。研究表明这可能是胃肠道同型产乙酸菌长期适应富含甲酸生境的结果,也提示甲酸脱氢酶基因似乎独立于Wood-Ljugdahl途径其它基因单独进化。该研究结果为同型产乙酸菌的生境适应提供了新的见解。
该研究相关内容由姚叶同学在符波副教授和刘和教授的指导下完成。该研究得到了江苏省自然科学基金的资助。